草果全株由根、根状茎、直立茎、叶、花、果实和种子七个部份组成。
根系分支撑根(其实为根状茎)和营养根。支撑根即为主茎下部肥大似姜，粗状有节的横走根状茎。
营养根是生长在支撑根两侧和顶端较细的粉红色须根，入土10－30公分，能生长到1－2米长，起吸收养分水分的作用。
茎分直立茎和根状茎。直立茎由横走根茎上的叶芽生出，丛生状，高达2.5—4米，深绿色，基部带有紫红色，圆柱形有节，直立或随坡势生长，一般有叶片12－16片。
根状茎在地下匍匐延伸，又称匍匐茎，由直立茎基部膨大处和根状茎节间向两侧对称生出新的匍匐茎，起支撑和储蓄养分的作用。
根状茎生长到一定的程度便会向上抽出新芽，次年长成新的植株(直立茎)。根状茎上鳞片内的潜伏芽可萌发出花芽和叶芽，即萌发出花芽可长成花穗，萌发出叶芽则长成直立茎。
叶2列，具短柄或无柄。叶片长椭圆形或狭长圆形，长约55公分，宽达20公分，未端渐尖，基部渐狭，全缘、叶两面均光滑无毛。叶鞘开放，包茎。
草果为穗状花序，从根茎生出，呈球形，每穗有花60－120朵。花两性，螺旋状排列在花穗轴上，小花外有紫红色苞片，层层包住，故未开放的花穗外观为紫红色。
开放时，自下而上地以顺时针方向螺旋状上升逐渐开花，先开的花到时先谢。
草果的果实是属于不开裂额果，果实富含纤维，干后质地坚硬，果形仿锤形、卵圆形或近球形，螺旋式地密生于一个穗轴上。
每穗有果15－60个，每个果长2.5－4公分，直径1.4－2公分，其部有短果柄，幼果鲜红色，成熟时为紫红色，烘烤以后呈棕褐色，不开裂，带轫性而坚硬，有比较整齐的直纹纤维。
每个草果的果实内有20－66粒籽种。种子为多角形，长约0.4－0.7公分，宽约0.3－0.5公分，每个种子颗粒被一层白色海绵状薄膜所包住。
平均千粒重为120－140克，每千克鲜籽种约有6000－7000粒。
