金针菇也属于好气性菌类，在菌丝体生长发育阶段，必须有足够的氧气供应，才能保证菌丝健壮生长，如果二氧化碳浓度过高，会造成菌丝生长受阻，生活力下降。但是在子实体生长发育阶段，要求要有较高浓度的二氧化碳，因为二氧化碳的浓度决定菌盖的大小和菌柄的长短。
金针菇不同于其他食用菌，主要食用部分为菌柄，因此菌柄较长菌盖较小的子实体为优质子实体。如果出菇场地二氧化碳浓度低，则形成的子实体菌盖大，菌柄短，商品性差。当二氧化碳浓度较高时（达到0.114%-0.152%），菌盖生长会受到抑制，形成柄长盖小的优质菇。
金针菇菌丝生长不需要光线，在完全黑暗条件下菌丝体生长健壮。但是在子实体生长发育阶段需要一定的弱光条件，因为弱光可以促进原基的形成，诱导子实体整齐地向有光方向快速生长。
光线过强，菌柄短粗、菌盖易开伞、色泽深、绒毛多，商品性较差；在完全黑暗条件下子实体生长缓慢，菇体弱小，只形成菌柄，不形成菌盖；弱光条件下子实体菌柄细长，色泽黄亮，产量高、商品性好。
