由于山区海拔高差悬殊，立体气候明显，能够生长的中药材种类很多。但真正适宜规模种植的药材，其实并不多。另外，不同地域、不同海拔、不同坡向、不同地块，环境存在很大差异，适宜种植的中药材也不相同。因此，在种植之前，一定要先弄清不同地域适合种植哪些药材。
总体上讲，准备规模种植的药材，首先应该选择适应当地环境，已经在当地常年规模种植，栽培、采收、加工技术成熟，产量高而稳定，药材质量上乘，功效地道实在、确切可靠，疗效较好的“道地药材”；其次是当地常年搭配种植的小药材；再次是当地的野生中药材。这些中药材对当地环境适应性较好，一般都能种植成功，而且产量稳定、质量可靠。
对外来中药材，特别是一些小报、广告上刊登的“新、奇、特”“速生、高产、高效”品种，应持谨慎态度，要坚持先试验示范，种植成功后，经鉴定产品质量合格，效益可靠后再逐步推广，切不可头脑发热，匆忙大面积种植。
具体到山区不同区域，以海拔对中药材种类影响最大。最适宜种植药材的地域一般在海拔千米以上，适宜种植的主要药材品种有款冬花、党参、川乌、牛膝、川芎、独活、云木香、柴胡、桔梗、黄连和天麻等。
一些濒于灭绝的名贵野生中药材（如七叶一枝花），近年来由于价格暴涨逐步引起高山药农关注，开始人工驯化栽培。由于中药材生长年限较长（少数1～2年，多数在3～5年），且根系密集发达，枝叶覆盖度高、覆盖时间长，能够减少土地裸露，防治水土流失，利于环境保护。因此，从长远看，它是替代对高山生态环境影响较大的烤烟以及部分农作物的最佳产业。
海拔千米以下的二高山与低山，适宜种植的中药材品种有金银花、留兰香、柴胡、桔梗、太子参、白芷、白芍药、牡丹皮、牛蒡子、瓜蒌、板蓝根、决明子和旱半夏等，但最好种植在年积温有限，农作物产量不高的二高山地区，且最好与农作物间作套种，或者在新退耕还林地与幼龄树苗套种，以提高种植效益，化解市场风险。
除草本药材外，从长远看，杜仲、厚朴、黄柏、山茱萸和银杏等木本药材在山区也较有发展前途。
