饥渴、寒冷、过热、拥挤等不良因素刺激，抑制体液免疫和细胞免疫，导致疫苗免疫保护力下降。
试验表明，传染性法氏囊病病毒的感染可使马立克氏病火鸡疱疹毒疫苗的免疫力下降20－40%，已接种马立克氏病疫苗的鸡群感染了传染性法氏囊病病毒后，再发生马立克氏病的比率超过没有感染传染性法氏囊病病毒鸡群的7倍以上。
有的病原微生物有多个血清型，在选择疫苗的时候必须考虑当时流行疫病的毒株，如果疫苗的血清型与感染的病毒或细菌血清型不同，则免疫后起不到保护作用。
马立克氏病毒存在超强毒株，火鸡疱疹病毒苗对其免疫效果很差。
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