畦作小麦，通常采用全层施肥的方法，即先将肥料均匀地撒在地表，然后翻地将肥料翻入土中，再进一步耙地、做畦、播种，这样肥料主要在下层，只有少部分肥料分布在上层土壤里。畦作小麦的翻地深度应不低于20厘米，以免肥料过于集中，影响小麦出苗。
施肥方法有3种：
一是全层施肥法，即在翻地整地之前，将肥料用撒肥机或人工均匀撒于地表，然后立即进行翻地整地，使肥料与土壤充分混合（减少肥料的挥发损失），然后根据当地的耕作方式，进行平播或起垄播种；
二是种间施肥法，即在播种时，先开沟，用人工将肥料施在种子间隔处，使肥料不与种子接触，保证一定的间隔（防止烧种），在人多地少机械化程度不高的地区，多采用此法；
三是侧位施肥法，即使用播种与施肥同步进行的机械，使得种子与肥料间隔距离在10厘米以上（防止由于肥料施用量集中出现的烧种现象发生）。玉米每亩参考施用量为15～22千克，种子与肥料的距离，一般以10～15厘米为宜，施肥量越大，要求肥料与种子之间保持的距离越大。肥料最好施在种子的斜下方，而不宜施在种子的垂直下方，以防幼根伸展时受到伤害。
要注意既要满足大豆对氮素的需要，又不妨碍根瘤的正常固氮。应采用侧位深施肥方式，即深开沟侧位施肥，合垄后在另一侧等距离点播或条播种子。每亩以施10千克左右为宜。北方地区也可采用类似玉米的秋季施肥方式。
垄作时，采用条施，先开15厘米深的沟，将长效尿素均匀撒入沟内，必要时与其他肥料一起施在沟内，然后合垄，进行常规播种。
