生物农药的防治效果与化学农药相比相对慢一些，但是具有降解、无残留或低残留以及对人畜，环境和天敌安全等特点，所以提倡在无公害作物种植时使用。
生物农药的种类较多，根据其来源分为植物源农药、动物源农药、矿物源农药和微生物源农药4类。
植物源农药是利用具有杀虫活性的植物某些部位制成，如鱼藤的根、除虫菊的花，或将植物中的杀虫物质提取出来加工成制剂，如鱼藤酮、苦参碱、印楝素、藜芦醇等。
包括植物性激素、三利素以及寄生性、捕食性的天敌动物，如赤眼蜂、瓢虫、捕食螨，各类天敌蜘蛛及昆虫病原线虫等。
包括石硫合剂、硫悬浮乳剂、可湿性硫等。
包括农用抗生素（如多抗霉素、浏阳霉素、华光霉素、春雷霉素等）和活体微生物农药（如白僵病、苏云金杆菌、核型多角体病毒、颗粒体病毒、绿僵菌等）。
生物农药的合成来源是生物活体及代谢产物或者基因表达的生物活性物质。而化学农药的合成来源则是有机化学合成。
生物农药的作用机理为营养竞争；提高植物抗性；活性拮抗物质专一杀虫抑菌。化学农药则是以毒杀为主。
生物农药选择性强，对人、畜等生物较安全，对非靶标生物影响较小，毒性低或没有毒性；对生态环境污染影响较小。
化学农药大量施用会导致残留量增加，严重污染环境；对病害虫杀伤力很大的同时也杀伤天敌生物，破坏生态平衡。
生物农药具有明显的后效作用，且病虫害不易产生抗药性。化学农药防治谱广，且见效快，效果显著。但长期大量使用，抗药性病害虫大量增加。
