小麦收获时正逢高温多湿气候，即使经过充分干燥，入库后如果管理不当，仍易吸湿回潮、生虫、发热、霉变，贮藏较为困难，因此必须掌握小麦种子贮藏技术要点。
据各地试验证明：种子水分不超过12％，如能防止吸湿回潮，种子可以进行较长时间贮藏而不生虫，不长霉，不降低发芽率；如果水分为13％，种温到30℃，则发芽率会有所下降；水分在14-14.5％，种温升高到21-23℃，如果管理不善，发霉可能性很大；水分为16％，即使种温在20℃，仍有很多发霉。
因此小麦贮藏时的水分应控制在10％以下，种温不超过25℃。
小麦种子耐热性较强，可以利用这一特点，将种子晒热后趁热进仓，不仅可以达到杀虫的目的，还可促进麦种加快通过休眼。具体做法是：
选择晴天天气将麦种暴晒，使种温达46℃度以上而不超过52℃，然后迅速入库堆放，面层加覆盖物，并将门窗密封保温，这样持续高温密闭7-10天后，进行通风冷却，使种温下降到与仓温相近，然后进入常规贮藏。
运用此法应掌握保温期间种温不宜过高，种子水分必须低于12％，还需设法防止地面与种子温差过大而引起底层结露；对于通过休眠的种子来说，由于耐热性有所减弱，一般不宜采用此法。
根据小麦种子吸湿性强的特点，种子在贮藏期间应严密封闭，防止外界水汽进入仓库，除密闭门窗外，种子堆上面还可以压盖蔑垫或麻袋等物，压盖要平整、严密、压实，有条件的，用10-15cm干燥砻塘灰压盖，既防虫又防湿。
对于用量少的，可用内外壁涂釉的瓮、甏 、坛、缸等器具存放种子，存放前充分干燥，存放后注意封口，在容器底部和种子表面如放一层干燥砻塘灰更为有利，器具放在屋内靠北荫凉处或埋入池下2/3，可安全贮藏较长时间。
种子在贮藏期间，要定期对种子温度、水分、发芽率以及仓库的温、湿度和虫霉鼠雀等情况进行检查，以便及时发现和处理问题。
