淡水鲳在越冬或放养初期，易发生细菌性和真菌性或小瓜虫、指环虫、隐鞭毛虫等多种疾病。对于常见的鱼病，国内外已有较多的防治药物。
近年来研究，发现淡水鲳对敌百虫等常用药物的敏感性与一般饲养鱼类不尽相同，有关测试结果如下：
1、敌百虫对淡水鲳的安全浓度仅为0.028mg/kg，而目前生产上对敌百虫的常用量为0.2-0.5mg／kg，因此该药禁用。
2、孔雀石绿不但安全浓度低，而且在0.135mg/kg以上就会引起“红头”症状。据报道，孔雀石绿有致癌作用．短期一次接触1/15000浓度可致细胞核突变，因此，该药应禁用。
3、硝酸亚汞的安全浓度低，该药也禁止使用。
4、漂白粉1.55mg/kg经96小时未发生中毒症状和死鱼，因此可慎用于浸洗和遍洒。若鱼体在越冬期间出现白皮病，用有效氯30%的漂白粉1mg/kg全池泼洒，效果很好。
5、生石灰的安全浓度在常用量范围内，生产上可根据池水条件适当使用，遍洒浓度为14.2mg/kg。
6、呋喃唑酮的安全浓度低，该药为禁用药。
7、食盐试验，当水中盐度达到1.5%时，经16小时死亡，而盐度在14%以下能生活正常，最好是在0.5&permi1;-1%盐度水体中越冬，能提高抗寒能力，又能起到良好的防病作用。
8、硫酸铜与硫酸亚铁合剂(5：2)，5.6mg/kg经240小时观察未见异常，因此采用0.7mg/kg计算遍洒量是安全的。
